Oferta de servicios

 


Grupo de investigación

Grupo de Genética de Micobacterias

Oferta de servicio

Epidemiología molecular de la tuberculosis.

Investigador de contacto

Carmen Lafoz

Resumen

Las cepas de M. tuberculosis, poseen dentro de su genoma, secuencias (IS6100, DRs, MIRU-VNTR) que permiten la diferenciación entre una y otra cepa.

 

Descripción detallada

Esta diferenciación dentro del genoma permite realizar estudios poblacionales, descartar o confirmar contaminaciones de laboratorio, estudios de brotes, etc. También se realiza la identificación de mutaciones que confieren resistencia a las cepas de M. tuberculosis.

Ensayos específicos

RFLP-IS6110, Spoligotyping, MIRU-VNTR

Técnicas y equipos

Laboratorio de seguridad tipo 3, cabinas de seguridad BIO II, autoclave de doble puerta, congeladores de -80ºC, Termociclador, Nanodrop, cubetas de electroforesis, bandeja de transferencia a membrana de nylon por medio de vacío.

Mercado objetivo

Laboratorios de microbiología
Grupos de investigación en tuberculosis

Aplicaciones al mercado

Identificación de modo rápido de la resistencia a antibióticos de M. tuberculosis complex
Identificación de contaminaciones
Estudio de brotes

Proyectos y contratos destacables

CYTED 207RT0311 Red de Epidemiología Molecular de la Tuberculosis Multirresistente en Iberoamérica – MULTITUB

FIS 06/1624 Epidemiología molecular de la tuberculosis multirresistente en España: Caracterización molecular y estudio de la función de IS6110 en virulencia y resistencia

SAI Servicio de Apoyo a la Investigación Secuenciación y Separación Celular de la Universidad de Zaragoza



Grupo de investigación

Grupo de Genética de Micobacterias

Oferta de servicio

Identificación de micobacterias.

Investigador de contacto

Carmen Lafoz

Resumen

En los últimos años ha habido un aumento considerable de las micobacterias no tuberculosas(MNT) aisladas en pacientes con una patología añadida. En el mercado existen pruebas estandarizadas para el diagnósticos de las más frecuentes, pero hay especies que, dada su baja incidencia hasta la fecha, o que son de reciente aparición no están contempladas.

Descripción detallada

Es una técnica basada en la PCR, con lo que se requiere muy poca muestra, y por lo tanto se puede identificar con rapidez. Se realiza la amplificación de una secuencia que está conservada en todas las micobacterias, pero que a su vez tiene pequeños cambios dentro de ella, y ésto es lo que  utilizamos para su identificación.

Ensayos específicos

1.- P.R.A. (Análisis del polimorfismo de los fragmentos de restricción del gen hsp65)
2.- Secuenciación 16S

Técnicas y equipos

Termociclador para la amplificación del fragmento, baños de temperatura (37ºC), cubetas de electroforesis, lámpara de UV

Mercado objetivo

Laboratorios de microbiología
Grupos de investigación en tuberculosis

Aplicaciones al mercado

Identificación de micobacterias, sobre todos MNT, no contempladas dentro de los kits comerciales, usados en los laboratorios de microbiología de los hospitales.
Identificación de M. tuberculosis complex, y MNT

Proyectos y contratos destacables

SAI Servicio de Apoyo a la Investigación Secuenciación y Separación Celular de la Universidad de Zaragoza



Grupo de investigación

Grupo de Genética de Micobacterias

Oferta de servicio

Ensayos de sensibilidad del bacilo de la tuberculosis frente a nuevos fármacos.

Investigador de contacto

José Antonio Aínsa

Resumen

El número de fármacos contra la tuberculosis es muy reducido, y por este motivo, es necesario descubrir nuevos fármacos para tratar esta enfermedad. Numerosos grupos de investigación y compañías farmacéuticas están desarrollando programas para identificar nuevos compuestos que sean activos frente al bacilo de la tuberculosis, pero para ensayarlos es necesario disponer.

Descripción detallada

Realizamos ensayos de susceptibilidad in vitro, en las que el bacilo se enfrenta a una serie de diluciones del compuesto, para determinar si se produce crecimiento o no, lo que se puede cuantificar mediante un indicador coloreado (resazurina). Para los ensayos previos se utilizan M. smegmatis y M. bovis BCG, y esto sirve para seleccionar los compuestos que presenten mejor actividad para ser ensayados frente a M. tuberculosis.

Ensayos específicos

Determinación de la Concentración Mínima Inhibitoria (CIM) extracelular e intracelular
Determinación de la tasa de mutación. Evaluación de posibles mecanismos de resistencia.

Técnicas y equipos

Laboratorios de seguridad biológica de nivel 2 y 3, para trabajar con las distintas bacterias.
Fluorímetro, para cuantificar de forma precisa el viraje de la resazurina.
Material básico de laboratorio de microbiología, para la preparación de materiales y eliminación de residuos.

Mercado objetivo

Compañías farmacéuticas y químicas
Grupos de investigación

Aplicaciones al mercado

Estas técnicas se utilizan para realizar un screening de colecciones de compuestos, para determinar si tienen o no actividad contra el bacilo de la tuberculosis. Los compuestos que presentan actividad son seleccionados para producir nuevos compuestos derivados con mejores propiedades. El objetivo final es que alguno de estos compuestos pueda ser comercializado como nuevo fármaco contra la tuberculosis.

Proyectos y contratos destacables

BIO-2005-01801 Estudio sistemático para identificar nuevos mecanismos de resistencia intrínseca a antibióticos en micobacterias

SAI Servicio de Apoyo a la Investigación Secuenciación y Separación Celular de la Universidad de Zaragoza



Grupo de investigación

Grupo de Genética de Micobacterias

Oferta de servicio

Caracterización molecular de la resistencia del bacilo de la tuberculosis.

Investigador de contacto

 Sofia Samper (samper@unizar.es) 

Resumen

La tuberculosis es una enfermedad infecciosa en cuya base del tratamiento es la asociación de isoniacida y rifampicina, junto con pirazinamida y/o etambutol, durante un largo periodo de tiempo (4+2 meses). Este tratamiento es efectivo en el caso de que se realice correctamente. En caso contrario aparecen resistencias que se pueden ir acumulando y dificultan el tratamiento. Como fármaco de segunda línea tienen gran importancia las fluoroquinolonas.

Descripción detallada

Estudio de los genes que más frecuentemente se encuentran implicados en resistencia a los fármacos utilizados en el tratamiento de la tuberculosis. En la resistencia a isoniacida están implicados los genes katG y inhA, en la resistencia a rifampicina el gen rpoB, a pirazinamida pncA, y para las fluoroquinolonas gyrA y gyrB.

Ensayos específicos

Estudio de los genes katG, inhA, rpoB, pncA, gyrA

Técnicas y equipos

Secuenciación rpoB, pncA, gyrA, multiplex katG

Mercado objetivo

Laboratorios de Microbiología
Grupos de investigación

Aplicaciones al mercado

Detección rápida de casos de tuberculosis multirresistente.

Proyectos y contratos destacables

CYTED 207RT0311 Red de Epidemiología Molecular de la Tuberculosis Multirresistente en Iberoamérica – MULTITUB

FIS 06/1624 Epidemiología molecular de la tuberculosis multirresistente en España: Caracterización molecular y estudio de la función de IS6110 en virulencia y resistencia

SAI Servicio de Apoyo a la Investigación Secuenciación y Separación Celular de la Universidad de Zaragoza